Proteómica - Plataforma biotecnológica

La proteómica es una disciplina postgenómica y que está relacionada con el producto final de la expresión genética (el proteoma). Existen varias tecnologías aplicadas al análisis de proteínas. La que desarrollamos en el Instituto de Biotecnología es la separación o fraccionamiento en dos dimensiones en geles de poliacrilamida SDS (2-D PAGE). 2-D PAGE permite la separación de varios miles de proteínas en solo un gel con un alto nivel de resolución. En una dimensión las proteínas serán separadas por su carga (punto isoeléctrico) y en la segunda dimensión por su masa. El uso de 2D-PAGE con gradiente inmovilizado de pH permite alto nivel de resolución, reproducibilidad y alta capacidad de cargado para fines preparativos.

Cuando las muestras a procesar provengan de un organismo cuyo genoma (o EST) haya sido completa o parcialmente secuenciado, la espectrometría de masas (matrix-assisted laser desorption ionization MALDI MS) será usada para la identificación de proteínas. La digestión de las proteínas separadas por gel y el análisis de masa de los péptidos provee una "huella dactilar" de las masa de los péptidos la cual es comparada con los datos teóricos de las secuencias en las bases de datos. El Instituto de Biotecnología cuenta con el equipamiento requerido para realizar y analizar las electroforésis en dos dimensiones, con una capacidad de procesamiento simultáneo de hasta 12 geles. En esta área es importante la complementación de tecnologías con otros Centros o Redes de proteómica, en particular con aquellos que cuenten con equipamiento de espectrometría, tanto MALDI-TOFF, TOFF-TOFF y de trampa iónica.