Transcriptómica - Plataforma biotecnológica
Plataforma biotecnológica del Instituto de Biotecnología del INTA.
La transcriptómica se caracteriza por el monitoreo y análisis de expresión simultáneo de muchos genes utilizando macro- o micro-matrices de ADN (microarrays o chips de ADN). Las micromatrices de ADN típicamente consisten en miles de secuencias inmovilizadas en una superficie miniaturizada del tamaño de un portaobjetos. El ADN es unido a una superficie como nylon o portaobjetos de vidrio en una localización precisa y definida en una grilla. Las muestras son preparadas de las células o del tejido de interés. Para genotipificación las muestras son ADNs mientras que para los análisis de expresión la muestra es ARN o cADN. Las muestras de ADN/ARN marcadas con fluorescencia o radioactividad son aplicadas al arreglo donde el ADN de simple cadena se une a su hebra complementaria. El ADN/ARN marcado indica la posición exacta donde ocurrió la unión, permitiendo la detección automática por scanner. El resultado consiste en una lista de eventos de hibridación, indicando la presencia o la abundancia relativa de las secuencias específicas presentes en la muestra. El equipamiento requerido para realizar, detectar y analizar las hibridaciones en chips de vidrio (microarreglos) y filtros (macroarreglos) se encuentra disponible en el Instituto de Biotecnología y ha sido adquirido en el marco del Proyecto Estructurante de Biotecnología y Recursos Genéticos (PEByRG).
El análisis de los datos se realiza con el empleo de programas de bioinformática.
